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|本期目录/Table of Contents|

脂肪酸合成酶作为癌症治疗靶点的生物信息学分析(PDF)

《现代预防医学》[ISSN:1003-8507/CN:51-1365/R]

期数:
2020年03期
页码:
508-513
栏目:
实验技术及其应用
出版日期:
2020-02-15

文章信息/Info

Title:
Bioinformatics analysis on fatty acid synthase as a cancer target
作者:
孙东雷赵田禾赵曼羽张遵真
四川大学华西公共卫生学院/华西第四医院,四川 成都 610041
Author(s):
SUN Dong-lei ZHAO Tian-he ZHAO Man-yu ZHANG Zun-zhen
West China School of Public Health and West China Fourth Hospital, Sichuan University, Chengdu, Sichuan 610041, China
关键词:
脂肪酸合成酶癌症肝细胞癌非酒精性脂肪性肝病生物信息学
分类号:
R115
DOI:
-
文献标识码:
A
摘要:
目的 基于生物信息学探究脂肪酸合成酶(FASN)在癌症中的作用,为将FASN作为肿瘤诊断生物标志物和防控靶点提供线索。方法 从癌症基因组图谱TCGA数据库中获取10967份样本资料,采用cBioPortal和GEPIA肿瘤基因分析工具,探究FASN基因在癌症病人中的序列变化和表达情况,并进一步分析FASN在肿瘤组织和正常组织间的表达差异;从GEO数据库获取非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)病人的样本数据,分析FASN在NAFLD诱发肝细胞癌疾病进程中的作用;采用String数据库检索FASN相关蛋白并进行富集功能注释。结果 FASN基因在10967份癌组织样本中的改变率为4.60%,在肝细胞癌、膀胱癌等多种实体瘤中表达上升;FASN在NAFLD组和对照组的表达值为9.78±0.74和8.99±1.21(P<0.05),在重度脂肪变性和轻度脂肪变性患者的表达值为791.89±420.59和562.85±432.87(P<0.05);FASN相关蛋白的生物学功能主要为介导蛋白间结合、调节催化酶活性以及调控能量代谢。结论 FASN与多种癌症的发生发展密切相关,靶向抑制FASN有希望成为肝细胞癌的治疗策略。

参考文献/References

-

备注/Memo

备注/Memo:
基金项目:国家自然科学基金(项目编号:81773380)
作者简介:孙东雷(1994 -),男,硕士在读,研究方向:环境毒理学
通讯作者:张遵真,E-mail:zhangzunzhen@163.com
更新日期/Last Update: 2020-02-15