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|本期目录/Table of Contents|

2016 - 2017年银川市手足口病CVA16亚型序列特征及分子流行病学分析(PDF)

《现代预防医学》[ISSN:1003-8507/CN:51-1365/R]

期数:
2019年14期
页码:
2514-2517
栏目:
流行病与统计方法
出版日期:
2019-07-25

文章信息/Info

Title:
Sequence characteristics and molecular epidemiology analysis of subtype CVA16 of hand-foot-and-mouth in Yinchuan from 2016 to 2017
作者:
纳玮1张伟宏1陈晓莉1张旭23
1. 银川市疾病预防控制中心病原微生物检验科,宁夏 银川 750011;
2. 宁夏医科大学总医院生物芯片国家工程研究中心宁夏分中心,宁夏 银川 750004;
3. 宁夏医科大学总医院(宁夏医科大学临床医学院),宁夏 银川 750004
Author(s):
NA Wei* ZHANG Wei-hong CHEN Xiao-li ZHANG Xu
*Yinchuan Center for Disease Control and Prevention, Yinchuan, Ningxia 750011, China
关键词:
手足口病柯萨奇病毒A组16型分子流行病学分析同源性进化分析
分类号:
R181.2
DOI:
-
文献标识码:
A
摘要:
目的 分析银川市2016 - 2017年手足口病(HFMD)CVA16亚型的序列特征及分子流行病学特征,为银川市HFMD的防治提供科学依据。方法 使用qPCR技术,检测2016 - 2017年银川市哨点医院送检的880份疑似标本,进行肠道病毒通用型和CVA16型核酸检测。随机选取每年5份CVA16标本,分离病毒,扩增VP1区基因片段病测序,对CVA16型的同源性进行分析,并构建系统进化树进行基因进化分析。结果 880份疑似标本中,阳性率为79.5%(700/880),其中CVA16阳性率为21.0%(147/880),2016年CVA16阳性率为40.3%(124/308);2017年CVA16阳性率为5.9%(23/392)。2016 - 2017年CVA16亚型发病高峰集中在2016年7月 - 12月,占全年CVA16阳性总数的86.3%(107例/124例),CVA16在2016年为优势亚型,而在2017为劣势亚型(P<0.01)。进化分析显示,10株CVA16与原型株(CVA16 - G10 - 1951)核苷酸序列同源性为75.9%~80.1%,10株间同源性为95.2%~99.7%,均集中于B2亚型进化分支,与中国大陆近年来CVA16流行的基因型一致。与同时期国内广东、福建、南京、云南等地的毒株序列亲缘关系较近,处于同1分支。结论 银川市HFMD CVA16亚型流行年龄集中于<5岁儿童,流行时间分布特征明显。2016 - 2017年银川市CVA16毒株未出现独立进化,而是与国内其他省份处于1个共循环状态。

参考文献/References

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备注/Memo

备注/Memo:
基金项目:自治区卫生计生委重点研究课题(2016 - NW - 073);宁夏高等学校一流学科建设(宁夏医科大学国内一流学科临床学院)资助项目(No.NXYLXK2017A05)
作者简介:纳玮(1985 - ),女,硕士学历,主管技师,研究方向:病原微生物的检测与分子特征研究
通讯作者,张旭,E - mail: xuzhang1012@163.com
更新日期/Last Update: 2019-07-22